在台灣近100年來，本土黑豬面臨過幾次族群危機：第一次是日據時期引進盤克夏豬，為了提高換肉率跟本土黑豬大量雜交，第二次是二次大戰後台糖、研究單位和民間豬農引進藍瑞斯、約克夏等生長快速的外來豬種，再次引種弱化本土黑豬種原，到近20年農村幾乎看不到純種的本土黑豬“台灣黑豬育種幾乎沒人在乎，種源也逐漸消逝”因此須從育種開始，以逆向檢測的方式，篩檢DNA序列，加強品種純化，期許與西班牙伊比利黑豬，日本鹿兒島黑豬，未來全球市場能享譽一句「台灣有平埔黑豬」促使產業提升。